สำนักงานอธิการบดี จัดตั้งขึ้นตามประกาศสำนักนายกรัฐมนตรี เรื่องการแบ่งส่วนราชการในมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ลงวันที่ 8 มกราคม 2515 ประกาศในราชกิจจานุเบกษา เมื่อวันที่ 17 มีนาคม 2515ปัจจุบันเปลี่ยนชื่อเป็น “สำนักงานมหาวิทยาลัย” ตามประกาศมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ เรื่อง “ให้ใช้ชื่อส่วนงาน “สำนักงานมหาวิทยาลัย” แทนชื่อส่วนงาน “สำนักงานอธิการบดี” ในระเบียบ ข้อบังคับ ประกาศ หรือคำสั่งของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์” ประกาศ ณ วันที่ 27 ตุลาคม 2564 เพื่อเป็นศูนย์รวมของหน่วยงานที่ทำหน้าที่ประสานงาน และสนับสนุนการบริหารงานตามพันธกิจของมหาวิทยาลัย ได้แก่ ด้านการบริหารจัดการทั่วไป ด้านบริหารงานบุคคล ด้านกิจกรรมนิสิต ด้านบริหารการเงิน ด้านวิชาการและการเรียนการสอน ด้านบริหารแผนงานและงบประมาณ ด้านวิเทศสัมพันธ์ ด้านสุขภาพและสิ่งแวดล้อม ด้านบริหารความเสี่ยง ด้านกฎมาย ด้านบริหารทรัพย์สินและสิทธิประโยชน์ ด้านบริการวิชาการ และด้านการกีฬา